MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome linear

Total Repeats: 40984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015508	GGTCC	2	10	58326	58335	0 %	20 %	40 %	40 %	332715428
1002	NC_015508	CG	3	6	58360	58365	0 %	0 %	50 %	50 %	332715428
1003	NC_015508	CGG	2	6	58403	58408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715428
1004	NC_015508	GCA	2	6	58412	58417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715428
1005	NC_015508	GAT	2	6	58488	58493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715428
1006	NC_015508	CTG	2	6	58494	58499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715428
1007	NC_015508	TTC	2	6	58756	58761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715429
1008	NC_015508	TCG	2	6	58900	58905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715429
1009	NC_015508	TCA	2	6	58919	58924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715429
1010	NC_015508	CAT	2	6	59010	59015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715429
1011	NC_015508	CGA	2	6	59061	59066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715429
1012	NC_015508	TTA	2	6	59135	59140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332715429
1013	NC_015508	A	6	6	59149	59154	100 %	0 %	0 %	0 %	332715429
1014	NC_015508	AGG	2	6	59180	59185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332715429
1015	NC_015508	CGA	2	6	59216	59221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715429
1016	NC_015508	TGG	2	6	59227	59232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332715429
1017	NC_015508	CGT	2	6	59251	59256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715429
1018	NC_015508	GGC	2	6	59332	59337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715429
1019	NC_015508	AAAAC	2	10	59383	59392	80 %	0 %	0 %	20 %	332715429
1020	NC_015508	GCC	2	6	59400	59405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715429
1021	NC_015508	CA	3	6	59466	59471	50 %	0 %	0 %	50 %	332715429
1022	NC_015508	GCC	2	6	59578	59583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715429
1023	NC_015508	CTC	2	6	59683	59688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332715429
1024	NC_015508	GAC	2	6	59697	59702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715429
1025	NC_015508	CGT	2	6	59730	59735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715429
1026	NC_015508	ATC	2	6	59746	59751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715429
1027	NC_015508	GC	4	8	59785	59792	0 %	0 %	50 %	50 %	332715429
1028	NC_015508	CG	3	6	59828	59833	0 %	0 %	50 %	50 %	332715429
1029	NC_015508	CGT	2	6	59838	59843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715429
1030	NC_015508	CAG	2	6	59887	59892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715429
1031	NC_015508	CCGG	2	8	59895	59902	0 %	0 %	50 %	50 %	332715429
1032	NC_015508	GAG	2	6	59914	59919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332715429
1033	NC_015508	CTG	2	6	59941	59946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715429
1034	NC_015508	TCC	2	6	59969	59974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332715429
1035	NC_015508	AAG	2	6	60184	60189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332715430
1036	NC_015508	AGC	2	6	60198	60203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715430
1037	NC_015508	GAC	2	6	60322	60327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715430
1038	NC_015508	GCC	2	6	60385	60390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715430
1039	NC_015508	GAC	2	6	60401	60406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715430
1040	NC_015508	TGC	2	6	60414	60419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715430
1041	NC_015508	CACT	2	8	60539	60546	25 %	25 %	0 %	50 %	332715430
1042	NC_015508	ATCA	2	8	60550	60557	50 %	25 %	0 %	25 %	332715430
1043	NC_015508	GCC	2	6	60575	60580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715430
1044	NC_015508	CGC	2	6	60602	60607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715430
1045	NC_015508	TGC	2	6	60609	60614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715430
1046	NC_015508	AGTGC	2	10	60623	60632	20 %	20 %	40 %	20 %	332715430
1047	NC_015508	CGCC	2	8	60663	60670	0 %	0 %	25 %	75 %	332715430
1048	NC_015508	CTG	2	6	60677	60682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715430
1049	NC_015508	TGC	2	6	60772	60777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715430
1050	NC_015508	CGC	2	6	60792	60797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715430
1051	NC_015508	AT	4	8	60837	60844	50 %	50 %	0 %	0 %	332715430
1052	NC_015508	GGC	2	6	60864	60869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715430
1053	NC_015508	GCC	3	9	61006	61014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715431
1054	NC_015508	GCG	2	6	61020	61025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715431
1055	NC_015508	CCG	2	6	61026	61031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715431
1056	NC_015508	CAG	2	6	61060	61065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715431
1057	NC_015508	CCA	2	6	61077	61082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332715431
1058	NC_015508	GCG	2	6	61083	61088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715431
1059	NC_015508	AT	3	6	61174	61179	50 %	50 %	0 %	0 %	332715431
1060	NC_015508	AGACAT	2	12	61266	61277	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	332715431
1061	NC_015508	GC	3	6	61279	61284	0 %	0 %	50 %	50 %	332715431
1062	NC_015508	CGC	2	6	61402	61407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715431
1063	NC_015508	TGATC	2	10	61422	61431	20 %	40 %	20 %	20 %	332715431
1064	NC_015508	TTGA	2	8	61558	61565	25 %	50 %	25 %	0 %	332715431
1065	NC_015508	CGC	2	6	61626	61631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715431
1066	NC_015508	TCG	2	6	61647	61652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715431
1067	NC_015508	ACG	2	6	61670	61675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715431
1068	NC_015508	CAA	2	6	61746	61751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332715431
1069	NC_015508	CAA	2	6	61764	61769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332715431
1070	NC_015508	TCT	2	6	61853	61858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332715431
1071	NC_015508	CGC	2	6	61890	61895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715431
1072	NC_015508	TG	3	6	61961	61966	0 %	50 %	50 %	0 %	332715431
1073	NC_015508	GCG	2	6	61970	61975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715431
1074	NC_015508	CGGT	2	8	62064	62071	0 %	25 %	50 %	25 %	332715431
1075	NC_015508	GCA	2	6	62486	62491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715432
1076	NC_015508	TGA	2	6	62636	62641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715432
1077	NC_015508	TCGC	2	8	62795	62802	0 %	25 %	25 %	50 %	332715432
1078	NC_015508	TCG	2	6	62846	62851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715432
1079	NC_015508	AGC	2	6	62909	62914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715433
1080	NC_015508	CGGAC	2	10	62934	62943	20 %	0 %	40 %	40 %	332715433
1081	NC_015508	GAT	2	6	62955	62960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715433
1082	NC_015508	GCC	2	6	63010	63015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715433
1083	NC_015508	CCG	2	6	63019	63024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715433
1084	NC_015508	GCG	2	6	63040	63045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715433
1085	NC_015508	TTG	2	6	63173	63178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332715433
1086	NC_015508	TTG	2	6	63196	63201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332715433
1087	NC_015508	TCC	2	6	63218	63223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332715433
1088	NC_015508	GTC	2	6	63584	63589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715434
1089	NC_015508	GGAAA	2	10	63601	63610	60 %	0 %	40 %	0 %	332715434
1090	NC_015508	GAC	2	6	63633	63638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715434
1091	NC_015508	CCG	2	6	63681	63686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715434
1092	NC_015508	TCC	2	6	63703	63708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332715434
1093	NC_015508	TGA	2	6	63722	63727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715434
1094	NC_015508	ATA	2	6	63756	63761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332715434
1095	NC_015508	ATC	2	6	63766	63771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715434
1096	NC_015508	CG	3	6	63783	63788	0 %	0 %	50 %	50 %	332715434
1097	NC_015508	GCC	2	6	63793	63798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715434
1098	NC_015508	T	7	7	64003	64009	0 %	100 %	0 %	0 %	332715434
1099	NC_015508	A	6	6	64202	64207	100 %	0 %	0 %	0 %	332715435
1100	NC_015508	GCG	2	6	64211	64216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715435
1101	NC_015508	GCT	2	6	64260	64265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332715435
1102	NC_015508	GGC	2	6	64322	64327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715435
1103	NC_015508	GAT	2	6	64347	64352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332715435
1104	NC_015508	CAA	2	6	64448	64453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332715435
1105	NC_015508	GC	3	6	64568	64573	0 %	0 %	50 %	50 %	332715435
1106	NC_015508	GCTG	2	8	64713	64720	0 %	25 %	50 %	25 %	332715435
1107	NC_015508	CCG	2	6	64801	64806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715435
1108	NC_015508	TCA	2	6	64819	64824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332715435
1109	NC_015508	CGC	2	6	64832	64837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332715435
1110	NC_015508	AC	3	6	64862	64867	50 %	0 %	0 %	50 %	332715435
1111	NC_015508	GC	3	6	64874	64879	0 %	0 %	50 %	50 %	332715435
1112	NC_015508	CGG	2	6	64930	64935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715435
1113	NC_015508	AAG	2	6	64944	64949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332715435
1114	NC_015508	CGA	2	6	64991	64996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715435
1115	NC_015508	GTCA	2	8	65112	65119	25 %	25 %	25 %	25 %	332715435
1116	NC_015508	GGCAA	2	10	65124	65133	40 %	0 %	40 %	20 %	332715435
1117	NC_015508	GCAA	2	8	65218	65225	50 %	0 %	25 %	25 %	332715435
1118	NC_015508	CT	3	6	65238	65243	0 %	50 %	0 %	50 %	332715435
1119	NC_015508	GCG	2	6	65263	65268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715435
1120	NC_015508	CGG	2	6	65285	65290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715435
1121	NC_015508	GAC	2	6	65328	65333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715435
1122	NC_015508	CG	3	6	65342	65347	0 %	0 %	50 %	50 %	332715435
1123	NC_015508	GGA	2	6	65348	65353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332715435
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1125	NC_015508	CGG	2	6	65552	65557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715435
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1252	NC_015508	CGG	2	6	71404	71409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332715440
1253	NC_015508	GAC	2	6	71477	71482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332715440
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1374	NC_015508	GA	3	6	78014	78019	50 %	0 %	50 %	0 %	332715449
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1497	NC_015508	CCA	2	6	85787	85792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332715454
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